本文旨在探讨如何处理深圳公司税务纠纷中的税务合规监督问题。通过对税务合规监督的六个关键方面进行详细分析，本文为深圳公司在面对税务纠纷时提供了有效的合规监督策略，以确保公司税务事务的合法性和合规性。

一、加强税务法律法规学习

1. 定期组织内部培训：深圳公司应定期组织员工参加税务法律法规的培训，提高员工对税法的理解和认识。

2. 建立税务知识库：公司可以建立税务知识库，收集整理最新的税务政策、法规和案例，方便员工查阅和学习。

3. 邀请专家讲座：定期邀请税务专家进行讲座，为员工提供专业的税务知识讲解，提高员工的税务合规意识。

二、完善税务管理制度

1. 制定税务管理制度：公司应制定完善的税务管理制度，明确税务工作的流程、职责和权限。

2. 建立税务风险预警机制：对税务风险进行识别、评估和预警，及时采取措施防范和化解税务风险。

3. 强化税务内部控制：加强税务内部控制，确保税务工作的规范性和合规性。

三、加强税务核算管理

1. 严格执行会计制度：确保会计核算的准确性和完整性，为税务核算提供可靠的数据支持。

2. 定期进行税务自查：定期对税务核算进行自查，及时发现和纠正税务核算中的问题。

3. 加强税务核算人员培训：提高税务核算人员的专业素质，确保税务核算的准确性。

四、加强与税务机关的沟通

1. 建立良好关系：与税务机关建立良好的沟通关系，及时了解最新的税务政策法规。

2. 定期汇报税务工作：定期向税务机关汇报税务工作，主动接受税务机关的监督和指导。

3. 积极配合税务机关调查：在税务机关进行调查时，积极配合，提供必要的资料和说明。

五、加强税务档案管理

1. 建立税务档案管理制度：制定税务档案管理制度，确保税务档案的完整性和安全性。

2. 规范税务档案管理流程：规范税务档案的收集、整理、归档和保管流程。

3. 定期检查税务档案：定期对税务档案进行检查，确保档案的准确性和完整性。

六、加强税务合规文化建设

1. 营造合规氛围：在公司内部营造良好的税务合规氛围，提高员工的合规意识。

2. 强化合规意识教育：通过多种形式的教育活动，强化员工的税务合规意识。

3. 建立合规激励机制：对在税务合规方面表现突出的员工给予奖励，激发员工的合规积极性。

处理深圳公司税务纠纷中的税务合规监督，需要从加强税务法律法规学习、完善税务管理制度、加强税务核算管理、加强与税务机关的沟通、加强税务档案管理和加强税务合规文化建设六个方面入手。通过这些措施，可以有效提高深圳公司的税务合规水平，降低税务风险，确保公司税务事务的合法性和合规性。